Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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