Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc5Q9CQA1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms