Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpa3Q9CQ71 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms