Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms