Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms