Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Chmp3Q9CQ10 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms