Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms