Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms