Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms