Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms