Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms