Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms