Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1aQ99L02 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms