Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan1Q99J59 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms