Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx18Q91ZR2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx18Q91ZR2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx18Q91ZR2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx18Q91ZR2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx18Q91ZR2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx18Q91ZR2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms