Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms