Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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