Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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