Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Colec12Q8K4Q8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Colec12Q8K4Q8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Colec12Q8K4Q8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Colec12Q8K4Q8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Colec12Q8K4Q8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Colec12Q8K4Q8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Colec12Q8K4Q8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Colec12Q8K4Q8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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