Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms