Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trappc12Q8K2L8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trappc12Q8K2L8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trappc12Q8K2L8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trappc12Q8K2L8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trappc12Q8K2L8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trappc12Q8K2L8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms