Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms