Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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