Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim68Q8K243 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms