Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms