Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms