Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms