Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc38Q8CDN8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms