Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8CCC3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms