Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm16223Q8CBM3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm16223Q8CBM3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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