Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8C708 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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