Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms