Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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