Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma1Q8C1C8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms