Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms