Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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