Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms