Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms