Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms