Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ChfrQ810L3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ChfrQ810L3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ChfrQ810L3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ChfrQ810L3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ChfrQ810L3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms