Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms