Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PhkbQ7TSH2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms