Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn1Q7TPR4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms