Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf139Q7TMV1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf139Q7TMV1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rnf139Q7TMV1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf139Q7TMV1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf139Q7TMV1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rnf139Q7TMV1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf139Q7TMV1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rnf139Q7TMV1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf139Q7TMV1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf139Q7TMV1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf139Q7TMV1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf139Q7TMV1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf139Q7TMV1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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