Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms