Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Timd4Q6U7R4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Timd4Q6U7R4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Timd4Q6U7R4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Timd4Q6U7R4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Timd4Q6U7R4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms