Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim37Q6PCX9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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