Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd7bQ6P4U0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms