Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms