Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ParpbpQ6IRT3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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